Detrás del particular atractivo del chihuahua color merle puede haber muchos defectos ocultos. Este color de chihuahua cada vez es más popular y la verdad no niego que es absolutamente precioso, pero ni dejan exponer con él ni criar, debido a la creencia de que hay muchos problemas de salud relacionados con este color.

El color de este chihuahua se generó por la búsqueda de lo diferente y se desarrolló alrededor del año 1991.
Los chihuahuas de color merle por lo general son algo más grandes que los chihuahuas de otros colores.
El gen merle es un color dominante y provoca la disolución, blanqueo o despigmentación del color, haciendo que el chihuahua pierda el pigmento no sólo de su manto sino también de las orejas y ojos, provocando sordera y ceguera en el perro.

El chihuahua doble merle (MM), es decir cuando ambos padres chihuahua son merle causan anormalidades en el esqueleto, corazón y genitales.